图库

这里展示 CatGo 在材料科学工作流中的可视化能力。

晶体结构

体相晶体

Diamond (C) - 经典 FCC 金刚石立方结构，具有四面体键合
Perovskite (SrTiO3) - 立方钙钛矿，包含 TiO6 八面体、晶格矢量和镜像原子
Rocksalt (NaCl) - 交替 Na/Cl 子晶格的离子晶体
Wurtzite (ZnO) - 带极性表面的六方结构

复杂结构

Metal-Organic Framework (MOF-5) - 大晶胞，包含有机 linker 和 Zn4O cluster
Zeolite (MFI) - 具有孔道系统的多孔硅酸盐骨架
Layered Material (MoS2) - 具有 Mo-S 键的范德华层状结构

表面 Slab

Miller 指数表面

Cu(111) - 密排 FCC 表面，4 层 slab，15 A 真空层
Fe(110) - BCC 表面，常用于催化研究
TiO2(110) Rutile - 带 bridging oxygen rows 的金属氧化物表面

Slab 切割器效果

切割平面预览 - 在体相晶体上叠加半透明平面，展示 (110) 切面
前后对比 - 将体相 FCC Cu 转换为带真空层的 (111) slab
吸附位点 - 在 Pt(111) 表面识别 atop、bridge 和 hollow 位点

光谱与分析

能带结构

Si band structure - 沿高对称 k 路径的电子能带，并高亮带隙
Band structure + DOS - GaAs 的能带结构和态密度并排显示

X 射线衍射

XRD pattern - 石英（SiO2）的模拟粉末衍射图谱，并带峰标签

径向分布函数

RDF plot - 非晶 SiO2 的 g(r)，展示 Si-O、O-O 和 Si-Si pair correlation

相图

二元相图

Li-Fe-O - 2D 凸包；稳定相位于凸包上，不稳定相按 above-hull energy 着色

三元相图

Li-Mn-O - 3D 三元图，带凸包面和稳定化合物标签

四元相图

Li-Fe-Mn-O - 交互式 3D 四面体，显示凸包面和相稳定性

密度可视化

CUBE 文件等值面

Benzene HOMO - 带正负叶瓣的分子轨道（蓝/红）
Electron density - Si 晶体总电荷密度等值面
Slice plane - 穿过钙钛矿电子密度的 2D 截面

轨迹播放

分子动力学

Water box MD - 液态水轨迹播放，并显示能量图
Surface diffusion - 金属表面上 adatom 在 1000 帧中的跃迁

优化路径

Geometry relaxation - 优化过程中结构的演化和能量收敛图
Cell optimization - NPT 弛豫过程中晶格参数的变化

组成与周期表

组成图

Pie chart - 高熵合金（HEA）的元素组成
Bubble chart - 按尺寸比例展示元素组成

交互式周期表

Element explorer - 悬停查看属性（原子质量、电负性、电子构型）
Heat map mode - 按所选属性为周期表着色

多平台

桌面应用（Tauri）

Native window - CatGo 作为独立 macOS/Windows/Linux 应用运行
File associations - 双击 CIF 文件即可直接在 CatGo 中打开

VSCode 扩展

Editor integration - 结构查看器嵌入 VSCode 面板，并与 CIF 文件编辑并排使用

Notebook visualization - 在 Jupyter notebook 中内联渲染交互式 3D 结构

显示模式

原子着色

Element colors - 标准 Vesta/Jmol CPK 颜色
Coordination number - 按邻居数量为原子着色（viridis 色标）
Wyckoff positions - 按对称位点为原子着色

视觉效果

Depth cueing - 在大型 MOF 结构上通过雾化效果增强深度感
Orthographic vs. perspective - 同一结构在两种投影模式中的效果
Dark vs. light theme - 结构查看器在深色和浅色主题下的效果

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