聚类与 PCA
Source: src/lib/md/MdClusteringPanel.svelte
概述
基于结构相似性对 MD 轨迹帧进行聚类，并通过 PCA 降维，以识别不同构象状态。
组件
MdClusteringPanel
用于配置聚类和 PCA 的交互式面板。
Algorithms
K-Means
基于结构描述符将帧划分为 k 个簇。
DBSCAN
基于密度的聚类方法，可自动确定簇数量。
Hierarchical
带树状图可视化的凝聚层次聚类。
PCA
主成分分析
将高维轨迹数据投影到捕获最大方差的正交主成分上。
可视化
在 PC1-PC2 空间中绘制帧的二维散点图，并按簇分配着色。
服务器 API
Endpoint: POST /api/md/clustering