氢键
Source: src/lib/md/MdHbondsPanel.svelte
概述
在 MD 轨迹帧中使用几何判据(距离和角度截断)检测氢键,并提供随时间变化的氢键数量及供体-受体对统计。
组件
MdHbondsPanel
用于配置氢键检测并查看结果的交互式面板。
检测判据
几何参数
d_cutoff— 最大供体-受体距离(默认:3.5 A)angle_cutoff— 最小 D-H-A 角(默认:120 度)
Element 配置
- 供体元素(通常为 N、O)
- 受体元素(通常为 N、O、F)
功能
Time Series
氢键数量随帧数变化。
配对统计
出现最频繁的供体-受体对。
寿命分析
氢键自相关和寿命估计。
服务器 API
Endpoint: POST /api/md/hbonds