Skip to content

氢键

Source: src/lib/md/MdHbondsPanel.svelte

概述

在 MD 轨迹帧中使用几何判据(距离和角度截断)检测氢键,并提供随时间变化的氢键数量及供体-受体对统计。

组件

MdHbondsPanel

用于配置氢键检测并查看结果的交互式面板。

检测判据

几何参数

  • d_cutoff — 最大供体-受体距离(默认:3.5 A)
  • angle_cutoff — 最小 D-H-A 角(默认:120 度)

Element 配置

  • 供体元素(通常为 N、O)
  • 受体元素(通常为 N、O、F)

功能

Time Series

氢键数量随帧数变化。

配对统计

出现最频繁的供体-受体对。

寿命分析

氢键自相关和寿命估计。

服务器 API

Endpoint: POST /api/md/hbonds

相关内容

CatGo 采用 AGPL-3.0-or-later。若 CatGo 对你的工作有所帮助,请注明 “This work used CatGo (https://app.catgo-ucsd.org).”并引用 CITATION.cff 中的首选文献;该请求不构成 AGPL 许可的附加条件。